92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3442 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  100 
 
 
496 aa  1001    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  67.84 
 
 
500 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  61.17 
 
 
519 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  61.16 
 
 
507 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  62.98 
 
 
464 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  62.98 
 
 
464 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  62.98 
 
 
464 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  62.77 
 
 
464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  62.77 
 
 
535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  62.55 
 
 
464 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  58.77 
 
 
454 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  49.31 
 
 
524 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  40.9 
 
 
471 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  40.08 
 
 
511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  41.4 
 
 
522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  35.86 
 
 
471 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  32.44 
 
 
503 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  39.67 
 
 
423 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  37.73 
 
 
455 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  32.57 
 
 
503 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  33.89 
 
 
448 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  30.32 
 
 
495 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  32.09 
 
 
665 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  33.08 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  30.91 
 
 
643 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  31.27 
 
 
454 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  31.82 
 
 
526 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  34.92 
 
 
533 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  29.19 
 
 
664 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  34.44 
 
 
526 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  34.65 
 
 
533 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  34.29 
 
 
507 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  33.33 
 
 
529 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  30.68 
 
 
549 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  33.15 
 
 
508 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  32.49 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  33.33 
 
 
500 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  33.52 
 
 
500 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  33.52 
 
 
500 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  33.52 
 
 
500 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  31.15 
 
 
525 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  32.06 
 
 
515 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  33.54 
 
 
503 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  28.43 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  32.55 
 
 
471 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  33.24 
 
 
505 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  30.94 
 
 
548 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  32.55 
 
 
467 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  32.02 
 
 
471 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  32.02 
 
 
487 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  32.02 
 
 
487 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  32.02 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  32.02 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  30.39 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  29.74 
 
 
483 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  30.7 
 
 
470 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  28.28 
 
 
460 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  30.25 
 
 
538 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  34.91 
 
 
572 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  29.38 
 
 
545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  30 
 
 
541 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  33.71 
 
 
311 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  31.23 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  25.72 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  30.54 
 
 
404 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  28.71 
 
 
605 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  25.71 
 
 
565 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  27.3 
 
 
453 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  29.8 
 
 
668 aa  100  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  29.46 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  29.96 
 
 
628 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  30.12 
 
 
440 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  26.78 
 
 
555 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  29.28 
 
 
458 aa  93.2  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  29.01 
 
 
654 aa  90.5  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  28.08 
 
 
541 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  25.57 
 
 
545 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  26.8 
 
 
480 aa  87.8  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  26.48 
 
 
653 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  22.57 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  29.02 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  26.91 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  23.43 
 
 
494 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  25.83 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  25.57 
 
 
520 aa  67  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  27.31 
 
 
522 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  23.84 
 
 
645 aa  60.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  22.67 
 
 
604 aa  60.1  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  25.26 
 
 
647 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  25.58 
 
 
635 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  25.9 
 
 
587 aa  43.5  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>