91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2474 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  92.84 
 
 		 503 aa  916    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  100 
 
 		 503 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  37.97 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  39.91 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  35.55 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  36.45 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  32.57 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  36.19 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  32.75 
 
 		 511 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  32.7 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  32.89 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  33.2 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  33.01 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  33.01 
 
 		 464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  32.75 
 
 		 464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  33.26 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  32.89 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  31.81 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  30.41 
 
 		 507 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  31.75 
 
 		 471 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  32.48 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  29.94 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  36.92 
 
 		 665 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  32.7 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  28.07 
 
 		 495 aa  170  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  29.65 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  38.29 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  34.86 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  34.19 
 
 		 549 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  33.68 
 
 		 508 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  32.39 
 
 		 664 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  32.82 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  31.66 
 
 		 526 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  31.36 
 
 		 643 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  33.98 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  31.6 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  30.54 
 
 		 529 aa  136  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  29.32 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  29.06 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  29.06 
 
 		 467 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  34.81 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  29.19 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  29.19 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  29.43 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  29.43 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  30.19 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  30.19 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  37.56 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  30 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  34.01 
 
 		 572 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  31.16 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  30.03 
 
 		 513 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  30.17 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  30.77 
 
 		 538 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  30.07 
 
 		 515 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  30.07 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  30.6 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  30.6 
 
 		 545 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  31.23 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  29.58 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  29.62 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  28.3 
 
 		 399 aa  100  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  27.59 
 
 		 653 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  29.67 
 
 		 628 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  31.67 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  27.68 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  27.22 
 
 		 654 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  24.86 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  26.09 
 
 		 404 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  30.18 
 
 		 668 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  30.13 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  28.31 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  24.94 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  26.3 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  28.26 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  33.51 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  26.14 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  26.55 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  28.3 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  25.71 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  24.6 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  29.35 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  26.64 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  24.36 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  27.27 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  28.23 
 
 		 647 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  27.57 
 
 		 635 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  26.12 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  24.9 
 
 		 604 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  24.08 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>