92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3892 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  68.19 
 
 
500 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  94.18 
 
 
464 aa  874    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  63.92 
 
 
519 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  98.92 
 
 
464 aa  907    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  92.67 
 
 
535 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  65.86 
 
 
507 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  93.1 
 
 
464 aa  866    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  62.98 
 
 
496 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  62.94 
 
 
454 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  49.46 
 
 
524 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  50.53 
 
 
511 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  40.86 
 
 
471 aa  322  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  42.86 
 
 
522 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  33.68 
 
 
471 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  38.95 
 
 
455 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  43.01 
 
 
423 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  35.71 
 
 
665 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  36.97 
 
 
448 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  32.36 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  35.71 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  35.61 
 
 
533 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  32.62 
 
 
503 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  29.05 
 
 
495 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  32.41 
 
 
664 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  33.08 
 
 
643 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  35.06 
 
 
526 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  33.33 
 
 
526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  35.98 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  30.41 
 
 
454 aa  196  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  35.43 
 
 
533 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  33.88 
 
 
532 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  33.18 
 
 
529 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  31.67 
 
 
549 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  34.58 
 
 
508 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  31.61 
 
 
525 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  34.75 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  33.92 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  33.92 
 
 
500 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  33.92 
 
 
500 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  33.63 
 
 
500 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  33.92 
 
 
515 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  33.12 
 
 
538 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  33.63 
 
 
505 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  33.15 
 
 
548 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  32.19 
 
 
467 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  31.91 
 
 
471 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  32.19 
 
 
471 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  29.68 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  33.14 
 
 
513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  29.39 
 
 
553 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  31.62 
 
 
487 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  31.62 
 
 
487 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  31.62 
 
 
471 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  31.62 
 
 
467 aa  127  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  33.33 
 
 
545 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  32.18 
 
 
541 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  34.6 
 
 
572 aa  126  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  33.64 
 
 
503 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  35.25 
 
 
460 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  27.6 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  30.64 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  33.57 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  29.93 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  26.41 
 
 
555 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  29.03 
 
 
399 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  29.01 
 
 
541 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  27.3 
 
 
453 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  28.75 
 
 
605 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  29.57 
 
 
668 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  30.79 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  27.89 
 
 
458 aa  94  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  28.66 
 
 
628 aa  90.1  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  25.9 
 
 
480 aa  89  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  29.38 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  21.89 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  26.47 
 
 
545 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  30.86 
 
 
555 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  25.71 
 
 
654 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  25 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  28.74 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  28.39 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  26.99 
 
 
520 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  24.21 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  27.66 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  25.58 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  28.26 
 
 
635 aa  63.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  24.62 
 
 
645 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  22.45 
 
 
548 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  26.67 
 
 
587 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>