91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1975 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  932    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  43.07 
 
 
483 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  45.11 
 
 
572 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  36 
 
 
525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  32.43 
 
 
454 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  33 
 
 
457 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  37.78 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  30.22 
 
 
495 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  28.43 
 
 
643 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  31.64 
 
 
532 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  33.89 
 
 
549 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  32.02 
 
 
665 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  30.81 
 
 
526 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  27.98 
 
 
664 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  30.5 
 
 
526 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  31.18 
 
 
533 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  29.23 
 
 
565 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  27.37 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  33.75 
 
 
511 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  34.9 
 
 
524 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  28.6 
 
 
555 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  31.93 
 
 
507 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  36.51 
 
 
423 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  31.31 
 
 
529 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  35.14 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  29.6 
 
 
471 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  32.72 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  33.03 
 
 
464 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2184  Protein of unknown function DUF1800  36.09 
 
 
503 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0521136  normal  0.739812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  30.42 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  34.38 
 
 
535 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  31.32 
 
 
500 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  28.28 
 
 
496 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2474  Protein of unknown function DUF1800  34.96 
 
 
503 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  35.25 
 
 
464 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  35.25 
 
 
464 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  35.25 
 
 
464 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  29.49 
 
 
471 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2182  hypothetical protein  32.89 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2352  hypothetical protein  33.23 
 
 
448 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  31.15 
 
 
519 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  26.93 
 
 
548 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  32.08 
 
 
507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  33.23 
 
 
522 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  29.59 
 
 
545 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  33.33 
 
 
513 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  26.41 
 
 
453 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  28.43 
 
 
470 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  26.23 
 
 
478 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  32.64 
 
 
548 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  29.48 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  27.99 
 
 
515 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  29.48 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  27.9 
 
 
505 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  29.64 
 
 
500 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  31.56 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  28.92 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  28.92 
 
 
487 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  31.56 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  26.05 
 
 
605 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  32.48 
 
 
471 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  32.48 
 
 
471 aa  94  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  32.48 
 
 
467 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  29.72 
 
 
545 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  29.08 
 
 
500 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  28.33 
 
 
538 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  27.9 
 
 
541 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  30.36 
 
 
311 aa  90.1  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  25.06 
 
 
480 aa  90.1  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  29.08 
 
 
503 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  28.21 
 
 
465 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  30.77 
 
 
471 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  27.2 
 
 
668 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  28.2 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  29.36 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  27.68 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  26.64 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  25.61 
 
 
653 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  32.09 
 
 
458 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  27.62 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  25.07 
 
 
555 aa  77  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  27.78 
 
 
628 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  25 
 
 
654 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0968  hypothetical protein  27.65 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248356  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  26.03 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  25.13 
 
 
587 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  24.84 
 
 
522 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  24.32 
 
 
635 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  22.87 
 
 
604 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  23.87 
 
 
494 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  23.63 
 
 
645 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>