More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4588 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4588  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  727    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  44.85 
 
 
389 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  45.3 
 
 
356 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  43.55 
 
 
379 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.47 
 
 
358 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  42.3 
 
 
394 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  43.82 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  42.3 
 
 
387 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  44.17 
 
 
384 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  42.27 
 
 
363 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  43.06 
 
 
364 aa  279  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  43.33 
 
 
359 aa  278  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  44.69 
 
 
356 aa  278  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  42.25 
 
 
370 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.73 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  42.13 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  42.06 
 
 
356 aa  273  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.01 
 
 
382 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  45.98 
 
 
356 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.33 
 
 
371 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  43.27 
 
 
361 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  40.73 
 
 
375 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  46.05 
 
 
356 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  42.77 
 
 
360 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0402  MRP protein-like  41.03 
 
 
358 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  51.94 
 
 
305 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  43.45 
 
 
354 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  40.77 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22681  hypothetical protein  41.16 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  44.69 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  40.05 
 
 
395 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  42.3 
 
 
358 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  42.3 
 
 
358 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  40.77 
 
 
353 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  41.39 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  41.28 
 
 
388 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  40.53 
 
 
376 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  41.87 
 
 
367 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
298 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  42.36 
 
 
364 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.41 
 
 
348 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  42.13 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  43.87 
 
 
358 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  52.14 
 
 
361 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  41.9 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  40.38 
 
 
367 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  38.16 
 
 
368 aa  258  9e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  41.57 
 
 
354 aa  258  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  39.19 
 
 
357 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  39.09 
 
 
347 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  46.06 
 
 
375 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  41.46 
 
 
351 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  38.5 
 
 
357 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  43.18 
 
 
362 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  39.27 
 
 
366 aa  256  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  41.44 
 
 
365 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  40.11 
 
 
360 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  40.58 
 
 
372 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  37.64 
 
 
367 aa  255  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.5 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  42.98 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  40.58 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  52.14 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  41.41 
 
 
336 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  51.12 
 
 
374 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  44.18 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  41.64 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  50.61 
 
 
415 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  40.29 
 
 
370 aa  252  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  51.87 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1673  MRP protein-like  36.29 
 
 
356 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.0087484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  39.58 
 
 
373 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  40.56 
 
 
363 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  39.38 
 
 
379 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  37.08 
 
 
368 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  45.77 
 
 
360 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.46 
 
 
362 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1593  ATP/GTP-binding protein  37.71 
 
 
368 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  40.9 
 
 
362 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  52.14 
 
 
382 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 
363 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1778  ATP/GTP-binding protein  37.43 
 
 
368 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.9 
 
 
362 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17721  MRP protein-like protein  36.34 
 
 
357 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17681  hypothetical protein  36.65 
 
 
355 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.400744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  40.65 
 
 
383 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  40.55 
 
 
367 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  42.25 
 
 
363 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  42.98 
 
 
357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  36.94 
 
 
366 aa  246  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20271  hypothetical protein  38.02 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1153  ATPase  38.02 
 
 
361 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  38.86 
 
 
368 aa  245  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17881  hypothetical protein  36.29 
 
 
356 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  40.96 
 
 
362 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  52.85 
 
 
285 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  42.23 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  39.84 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>