More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_50012 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_50012  predicted protein  100 
 
 
489 aa  1014    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287976  normal  0.08964 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53355  RNA helicase required for poly(A+) mRNA export  40.93 
 
 
500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.390425 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07659  ATP-dependent RNA helicase dbp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVM1]  38.46 
 
 
477 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.532365  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_1990  predicted protein  42.39 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01880  ATP-dependent RNA helicase, putative  38.32 
 
 
546 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47384  predicted protein  40 
 
 
491 aa  257  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06360  conserved hypothetical protein  36.7 
 
 
396 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08016  ATP-dependent RNA helicase fal1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUL4]  35.62 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687737  normal  0.0336858 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26958  predicted protein  35.2 
 
 
404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0164811 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25743  predicted protein  35.2 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.628861  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52941  RNA helicase involved in maturation of 18S rRNA  35.29 
 
 
399 aa  216  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0572699  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.89 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.92 
 
 
621 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.99 
 
 
655 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.68 
 
 
653 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.92 
 
 
629 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.94 
 
 
624 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.92 
 
 
629 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.92 
 
 
629 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.92 
 
 
629 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.97 
 
 
632 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02932  ATP-dependent RNA helicase eIF4A (EC 3.6.1.-)(Eukaryotic initiation factor 4A)(eIF-4A)(Translation initiation factor 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B948]  37.76 
 
 
398 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
629 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
651 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
651 aa  207  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
651 aa  207  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.67 
 
 
629 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
634 aa  206  7e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.9 
 
 
625 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10417  ATP-dependent RNA helicase (Eurofung)  35.92 
 
 
498 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.880025  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
610 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
623 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32748  predicted protein  33.42 
 
 
413 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0334317  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.26 
 
 
664 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.26 
 
 
664 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.26 
 
 
664 aa  203  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.89 
 
 
599 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.34 
 
 
605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 
557 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.54 
 
 
557 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.62 
 
 
594 aa  201  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.54 
 
 
557 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06460  RNA helicase, putative  35.28 
 
 
625 aa  200  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90571  RNA helicase of DEAD box family  36.19 
 
 
509 aa  199  7.999999999999999e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0907295  normal  0.0189546 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74636  Eukaryotic initiation factor 4A (eIF4A) (eIF-4A)  35.57 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.471027  normal  0.975431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.7 
 
 
611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49732  predicted protein  34.55 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0305242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.97 
 
 
590 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.72 
 
 
637 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
541 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.72 
 
 
538 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.26 
 
 
529 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.07 
 
 
565 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41785  predicted protein  33.42 
 
 
370 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.982896  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.99 
 
 
623 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.52 
 
 
482 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 
602 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.45 
 
 
622 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.45 
 
 
622 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  33.93 
 
 
589 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  33.69 
 
 
589 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  33.93 
 
 
589 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 
583 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
527 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.19 
 
 
619 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
525 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  34.71 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  34.43 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.71 
 
 
525 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.71 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.71 
 
 
528 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  34.71 
 
 
533 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  33.33 
 
 
563 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.51 
 
 
528 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.51 
 
 
528 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.58 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  32.58 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.07 
 
 
550 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3987  DEAD/DEAH box helicase-like  32.61 
 
 
557 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  33.09 
 
 
590 aa  191  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 
572 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 
599 aa  191  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.98 
 
 
581 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.64 
 
 
669 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.16 
 
 
617 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  33.16 
 
 
617 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.03 
 
 
542 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0042601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.88 
 
 
532 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0610  DEAD/DEAH box helicase-like  33.58 
 
 
432 aa  189  9e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.83 
 
 
533 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.04 
 
 
589 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>