More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10071 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_10071  ABC(ATP-binding) family transporter (Uup-like protein/duplicated ATPase)  100 
 
 
512 aa  1014    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219692  normal  0.560831 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42695  ABC(ATP-binding) family transporter  48.08 
 
 
582 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0547165  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14391  predicted protein  42.88 
 
 
525 aa  340  4e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183197  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16142  predicted protein  40.81 
 
 
518 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000657873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  34.26 
 
 
619 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  36.29 
 
 
690 aa  282  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  32.49 
 
 
643 aa  280  4e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.72 
 
 
668 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 
645 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  35.14 
 
 
649 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.14 
 
 
645 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  34.79 
 
 
635 aa  273  8.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  34.81 
 
 
673 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.8 
 
 
635 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
635 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  33.13 
 
 
636 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.31 
 
 
649 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
640 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
640 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
640 aa  263  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
632 aa  263  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
638 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  35.59 
 
 
672 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.63 
 
 
545 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
643 aa  263  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.6 
 
 
709 aa  262  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.81 
 
 
641 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  32.3 
 
 
641 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.88 
 
 
543 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
635 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.3 
 
 
549 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.14 
 
 
637 aa  261  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
635 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.82 
 
 
543 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  31.68 
 
 
650 aa  260  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
639 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  33.33 
 
 
650 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  35.14 
 
 
650 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  31.2 
 
 
637 aa  259  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
635 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
635 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  33.53 
 
 
656 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  32.87 
 
 
654 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.07 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
635 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  35.56 
 
 
656 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 
637 aa  259  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
635 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  35.56 
 
 
656 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  33.13 
 
 
636 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  33.86 
 
 
637 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  33.86 
 
 
636 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  33.91 
 
 
664 aa  257  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  33.86 
 
 
637 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  33.86 
 
 
637 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 
637 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  33.2 
 
 
648 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 
637 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  35.66 
 
 
638 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  31.4 
 
 
630 aa  256  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  36.88 
 
 
633 aa  256  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1802  putative ATP-binding ABC transporter protein  34.83 
 
 
660 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235384  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  34.32 
 
 
637 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  34.32 
 
 
637 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  33.67 
 
 
637 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  32.42 
 
 
646 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  32.87 
 
 
638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.14 
 
 
540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  32.24 
 
 
544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  33.47 
 
 
637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  32.56 
 
 
564 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
648 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
767 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 
663 aa  253  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  32.82 
 
 
548 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
545 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 
636 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
634 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 
658 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
658 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
659 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 
658 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  35.67 
 
 
636 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
658 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 
640 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  34 
 
 
645 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  31.94 
 
 
639 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
644 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
634 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  33.99 
 
 
643 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 
532 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
662 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  30.65 
 
 
658 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>