258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1426 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  80.24 
 
 
250 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.88 
 
 
249 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.76 
 
 
250 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.95 
 
 
248 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.2 
 
 
250 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  67.87 
 
 
250 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.23 
 
 
253 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.82 
 
 
253 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.01 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.82 
 
 
251 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.77 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.37 
 
 
255 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.81 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.62 
 
 
246 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.81 
 
 
249 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.11 
 
 
258 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.63 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  42.86 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.94 
 
 
241 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.6 
 
 
241 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.31 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.08 
 
 
257 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.75 
 
 
241 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.55 
 
 
246 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.55 
 
 
246 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.15 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.25 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.92 
 
 
251 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.45 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.6 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.16 
 
 
239 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.8 
 
 
255 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.46 
 
 
258 aa  122  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  32.41 
 
 
282 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.1 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.78 
 
 
253 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
467 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.28 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0078  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.88 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.33 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.75 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.19 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.85 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.85 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.64 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.31 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.52 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.73 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.78 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.13 
 
 
594 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.3 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.65 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.75 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.49 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.5 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  32.79 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  31.97 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.37 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.97 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.79 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.53 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.38 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0218  hypothetical protein  26.22 
 
 
587 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.381171  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.86 
 
 
235 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0212  hypothetical protein  26.22 
 
 
587 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.59 
 
 
242 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1096  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.28 
 
 
250 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223987  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.94 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.61 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.86 
 
 
280 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.83 
 
 
250 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.42 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1686  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.39 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000482632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1882  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.58 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.028695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.12 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.62 
 
 
491 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4138  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.86 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.67 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.55 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.6 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.26 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.39 
 
 
334 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.018608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.26 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.65 
 
 
623 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1700  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.22 
 
 
247 aa  49.3  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.65 
 
 
623 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.63 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.7 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.75 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>