More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2320 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.26 
 
 
253 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.26 
 
 
253 aa  321  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  70.85 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  70.61 
 
 
251 aa  318  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.27 
 
 
255 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.62 
 
 
250 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.42 
 
 
250 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.82 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.21 
 
 
250 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.81 
 
 
250 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.82 
 
 
250 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.8 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.25 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.47 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.69 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.63 
 
 
236 aa  168  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.36 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.6 
 
 
258 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.75 
 
 
241 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.96 
 
 
241 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.1 
 
 
257 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.15 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.56 
 
 
239 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
246 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.58 
 
 
255 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.11 
 
 
246 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.11 
 
 
246 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.2 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  41.2 
 
 
256 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.2 
 
 
256 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.92 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.85 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.73 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.43 
 
 
251 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  32.28 
 
 
282 aa  119  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.58 
 
 
253 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
467 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.57 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.38 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.46 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.87 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.57 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.028695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4138  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.5 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.65 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.49 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4047  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.01 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.5 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.49 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.27 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30830  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.59 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  27.86 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.86 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.11 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.88 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0787  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.58 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3909  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.22 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0841832  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.59 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.86 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0858  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.58 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.49 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.14 
 
 
607 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  38.68 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.13 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.36 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.22 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  39.29 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.67 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.82 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.14 
 
 
607 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.08 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.55 
 
 
242 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.3 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.04 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.14 
 
 
607 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2347  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.84 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.14 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.72 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.44 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3655  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.52 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.37 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.37 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.54 
 
 
607 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1744  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.25 
 
 
219 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.79 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.22 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.52 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  34.3 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.54 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1000  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.48 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0943134  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.37 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0071  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.14 
 
 
607 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.96 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>