289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3314 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  76.71 
 
 
250 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  77.11 
 
 
250 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  74.6 
 
 
248 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  73.9 
 
 
250 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.37 
 
 
250 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.88 
 
 
250 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.44 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.23 
 
 
253 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.63 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.2 
 
 
251 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.44 
 
 
246 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.82 
 
 
249 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.6 
 
 
255 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.54 
 
 
249 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.53 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.02 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  42.02 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.24 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.31 
 
 
241 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.32 
 
 
236 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  37.86 
 
 
246 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  37.86 
 
 
246 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.48 
 
 
241 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.06 
 
 
256 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.74 
 
 
246 aa  135  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.29 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.29 
 
 
258 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.32 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.27 
 
 
239 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.34 
 
 
257 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  32.3 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.08 
 
 
251 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.06 
 
 
239 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.64 
 
 
253 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.4 
 
 
255 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.64 
 
 
467 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.06 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.25 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  32.79 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  33.61 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.34 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.54 
 
 
237 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.58 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.58 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.58 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.29 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.12 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.14 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.98 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.1 
 
 
247 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.1 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3651  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.31 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.652029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.97 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.6 
 
 
328 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.84 
 
 
233 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.69 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.97 
 
 
623 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.58 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.02 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.52 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.97 
 
 
623 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.62 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.69 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.57 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.97 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.52 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.1 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.87 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.87 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.17 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6463  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.21 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3495  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.59 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.65 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.17 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.86 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.03 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.83 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.25 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.85 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0749  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.91 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.61 
 
 
491 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.17 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0658  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.15 
 
 
611 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0078  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.07 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.02 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.1 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0504  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.33 
 
 
623 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.11 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.02 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.35 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.31 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1811  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.68 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00873752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.68 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000170657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3958  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.81 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0262456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0260  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.81 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.33 
 
 
623 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>