More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3104 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.4 
 
 
253 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.57 
 
 
241 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.09 
 
 
251 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.5 
 
 
251 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.02 
 
 
258 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  39 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.72 
 
 
236 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.3 
 
 
246 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 
257 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.22 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.51 
 
 
255 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.74 
 
 
241 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.8 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.18 
 
 
239 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.82 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.74 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.77 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.45 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.56 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.97 
 
 
249 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.28 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  40.44 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40 
 
 
256 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.8 
 
 
250 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.75 
 
 
258 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.55 
 
 
256 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.74 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.25 
 
 
249 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.11 
 
 
248 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.22 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.11 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.08 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
250 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.4 
 
 
249 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  31.12 
 
 
282 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.11 
 
 
467 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
369 aa  92.4  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.22 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.97 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.79 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.11 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.84 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.11 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.37 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.4 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.3 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3768  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.57 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0487365  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.31 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.67 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.2 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.38 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.09 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1636  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.56 
 
 
627 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.41391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.95 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.77 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.64 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.51 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.7 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
607 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.12 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.22 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.93 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.13 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0071  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.64 
 
 
607 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.52 
 
 
607 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.52 
 
 
607 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.9 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.89 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.11 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.26 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.23 
 
 
607 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.16 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.17 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.66 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  40 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.24 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.74 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.36 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.05 
 
 
241 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.74 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.028695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.46 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.78 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2174  hypothetical protein  36.21 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1744  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.5 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.43 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.26 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.04 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1715  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.94 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.942032  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.11 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  29.6 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.05 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.91 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.63 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.46 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>