More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3779 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  97.5 
 
 
240 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  97.08 
 
 
240 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  96.25 
 
 
240 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  84.58 
 
 
240 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  83.33 
 
 
240 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  81.25 
 
 
240 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  80.42 
 
 
240 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  80.83 
 
 
240 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  66.39 
 
 
244 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  63.33 
 
 
240 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.57 
 
 
231 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  64.85 
 
 
240 aa  299  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  60 
 
 
235 aa  298  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  62.01 
 
 
233 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.71 
 
 
235 aa  278  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  47.62 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
241 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.61 
 
 
228 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  37.99 
 
 
229 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.14 
 
 
227 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.89 
 
 
243 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.98 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.6 
 
 
242 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.62 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.16 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.2 
 
 
250 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.63 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  32.05 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.65 
 
 
241 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.93 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.93 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.22 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.35 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.93 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.35 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  31.54 
 
 
239 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.51 
 
 
241 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.58 
 
 
245 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.51 
 
 
241 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.18 
 
 
233 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  33.62 
 
 
241 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.22 
 
 
241 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.99 
 
 
247 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.51 
 
 
241 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.89 
 
 
250 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.47 
 
 
257 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146198 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.77 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.91 
 
 
247 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.6 
 
 
237 aa  99  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.71 
 
 
247 aa  98.2  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.96 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.3 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.83 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.93 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.33 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.05 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.31 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.75 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0868  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.68 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.76 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.73 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.63 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.06 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000060141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.63 
 
 
231 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.33 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
242 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.36 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.56 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0112  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.04 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.69 
 
 
239 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.4 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.86 
 
 
257 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.8 
 
 
304 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.44 
 
 
341 aa  85.5  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.61 
 
 
284 aa  85.1  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.82 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.27 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3752  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.63 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00938184  normal  0.068906 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.93 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.27 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.27 
 
 
293 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.7 
 
 
631 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.23 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.06 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.91 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.32 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.18 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.23 
 
 
287 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.21 
 
 
292 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.49 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.49 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  29.49 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0121  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.8 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.06 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.11 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.92 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>