More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04965 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.46 
 
 
227 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.41 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.05 
 
 
243 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.93 
 
 
239 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2737  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.75 
 
 
265 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  decreased coverage  0.00114829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.48 
 
 
236 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.22 
 
 
238 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.05 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.84 
 
 
224 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.05 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.61 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  35.27 
 
 
240 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.76 
 
 
257 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.16 
 
 
240 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
240 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.84 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
240 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.82 
 
 
240 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.33 
 
 
245 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.22 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.72 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.9 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.31 
 
 
243 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.56 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.89 
 
 
222 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.75 
 
 
257 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.04 
 
 
257 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.9 
 
 
259 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
242 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.7 
 
 
235 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.19 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.76 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.19 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.19 
 
 
241 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.19 
 
 
241 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.53 
 
 
235 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.76 
 
 
241 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.3 
 
 
296 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.2 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.76 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2973  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.45 
 
 
268 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
231 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.76 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.76 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3045  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.16 
 
 
226 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.62 
 
 
231 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2746  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.96 
 
 
253 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.89 
 
 
244 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.41 
 
 
233 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  30.43 
 
 
241 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.33 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.59 
 
 
228 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.8 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.7 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.11 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.82 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.47 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.91 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.43 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000060141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.49 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.44 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.16 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.48 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
240 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1345  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.63 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.3 
 
 
632 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000139686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0868  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.07 
 
 
297 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.672761  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3189  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.03 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.772379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 
241 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1744  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.68 
 
 
219 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.04 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.2 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.58 
 
 
251 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.35 
 
 
220 aa  94  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2245  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.18 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.39 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0756  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.09 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.997295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.86 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0653  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.09 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.72 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.31 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.14 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.29 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.98 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.028695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
238 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.39 
 
 
242 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3921  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.45 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0201404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.14 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.81 
 
 
273 aa  91.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4241  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.02 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.419754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3912  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.45 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000222775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4391  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.45 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>