More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1781 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.61 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.05 
 
 
240 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.61 
 
 
240 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.17 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.29 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.29 
 
 
240 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.85 
 
 
240 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  42.29 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.29 
 
 
240 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.17 
 
 
231 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  40 
 
 
236 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.85 
 
 
244 aa  174  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.09 
 
 
240 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.41 
 
 
233 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.77 
 
 
235 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.85 
 
 
240 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.91 
 
 
235 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.73 
 
 
227 aa  148  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.22 
 
 
241 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  34.33 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  33.91 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.04 
 
 
229 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  36.75 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.9 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.06 
 
 
250 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
241 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.75 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37 
 
 
594 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.47 
 
 
247 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.47 
 
 
245 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.76 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.09 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.12 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.76 
 
 
235 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.18 
 
 
241 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  33.76 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.78 
 
 
242 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.76 
 
 
241 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.76 
 
 
241 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.33 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.33 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.76 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.64 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.33 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.33 
 
 
241 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.25 
 
 
293 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.9 
 
 
304 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  34.58 
 
 
241 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.95 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.19 
 
 
249 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.59 
 
 
224 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3517  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.31 
 
 
314 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.76 
 
 
257 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.76 
 
 
632 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000139686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.49 
 
 
600 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.05 
 
 
631 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.71 
 
 
259 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.96 
 
 
234 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3270  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.39 
 
 
314 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.69 
 
 
247 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.76 
 
 
257 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.87 
 
 
233 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.88 
 
 
239 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3300  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.39 
 
 
314 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.39 
 
 
314 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2205  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.21 
 
 
314 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3503  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.04 
 
 
314 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0978  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.25 
 
 
309 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.51 
 
 
242 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.25 
 
 
309 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.76 
 
 
257 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
237 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.07 
 
 
231 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.48 
 
 
250 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.12 
 
 
276 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.95 
 
 
284 aa  101  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.87 
 
 
292 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  28.93 
 
 
287 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4506  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.17 
 
 
253 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2729  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.46 
 
 
277 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.560439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.75 
 
 
238 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1745  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.04 
 
 
314 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68144  normal  0.568819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3525  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.02 
 
 
314 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.13 
 
 
291 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ, putative  28.29 
 
 
349 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3514  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.65 
 
 
314 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.4 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.4 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.5 
 
 
257 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.57 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.98 
 
 
287 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.76 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  31.74 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.98 
 
 
287 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.91 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.98 
 
 
287 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.57 
 
 
314 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.17 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>