More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00547 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.606311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.64 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.957647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  43.75 
 
 
236 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.91 
 
 
240 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  39.91 
 
 
240 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3905  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.6 
 
 
240 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.53 
 
 
244 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.344899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3722  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.16 
 
 
240 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3779  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.99 
 
 
240 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.6 
 
 
240 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.47 
 
 
240 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0546  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.55 
 
 
240 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3292  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.43 
 
 
240 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.39 
 
 
233 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.45 
 
 
231 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.03 
 
 
235 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.81 
 
 
240 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000443759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3037  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.43 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307286  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.91 
 
 
235 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.04 
 
 
228 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.07 
 
 
224 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.15 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.56 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.200527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.39 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.51 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.33 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.93 
 
 
245 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.34 
 
 
249 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.2 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.92 
 
 
259 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.76 
 
 
250 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.45 
 
 
292 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.59 
 
 
233 aa  101  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31 
 
 
257 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146198 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.62 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.77 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.62 
 
 
291 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.54 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.19 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.03 
 
 
291 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.22 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.71 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.58 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3666  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.13 
 
 
288 aa  94.7  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2737  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.99 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  decreased coverage  0.00114829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.71 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.29 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.19 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.08 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.71 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.03 
 
 
287 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  33.91 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.79 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.62 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.62 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.62 
 
 
287 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.78 
 
 
287 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000205547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.08 
 
 
287 aa  92  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.88 
 
 
241 aa  92  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.06 
 
 
607 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.34 
 
 
236 aa  92  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.74 
 
 
296 aa  91.7  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.88 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.9 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3150  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.07 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1509  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.93 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.06 
 
 
607 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.83 
 
 
276 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.44 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
257 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.63 
 
 
607 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2972  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.51 
 
 
303 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.74647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0071  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.06 
 
 
607 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.39 
 
 
245 aa  88.6  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.63 
 
 
607 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.12 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.19 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.94 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.31 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.15 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1231  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.15 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.4 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.34 
 
 
248 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.28 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.22 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.25 
 
 
319 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.17 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.15 
 
 
299 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04965  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.28 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.3 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0885  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.95 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0088343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2137  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.22 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0265891  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.72 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.63 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.57 
 
 
255 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>