146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2785 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
253 aa  516  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.4 
 
 
255 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.37 
 
 
258 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.2 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.11 
 
 
246 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  36.51 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.14 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.51 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.25 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.61 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.73 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.47 
 
 
248 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
239 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.61 
 
 
241 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.32 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.19 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.11 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.4 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.47 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.11 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.84 
 
 
258 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.78 
 
 
250 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.64 
 
 
249 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.7 
 
 
281 aa  105  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  29.13 
 
 
282 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.85 
 
 
241 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.19 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.15 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.74 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.28 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.92 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.17 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.22 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.31 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.89 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.89 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.58 
 
 
249 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.01 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.02 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.57 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2347  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.17 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.22 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.52 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.76 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0834008  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0915  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.85 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.119218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2852  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.46 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0188  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.66 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.620509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.78 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25 
 
 
220 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.52 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2174  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.78 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.52 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  25.94 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.8 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.75 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.63 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.4 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.96 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2341  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.93 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0083656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.52 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4010  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.04 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.52 
 
 
241 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  25.52 
 
 
241 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.03 
 
 
247 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0957  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.59 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.52 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.88 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.61 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.82 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.94 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  25.1 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.85 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.68 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.93 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.63 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.11 
 
 
607 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.68 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.11 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.815956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  33.93 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1460  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.53 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1882  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.7 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2174  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.57 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00147475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.56 
 
 
607 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.56 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00970599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.93 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3486  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase- like protein  27.6 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.26 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1781  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.64 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1800  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.69 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.63 
 
 
237 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.94 
 
 
238 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2904  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000060141 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  23.15 
 
 
239 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.56 
 
 
607 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.78 
 
 
632 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000139686  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04050  conserved hypothetical protein  23.29 
 
 
373 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.991162  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.71 
 
 
341 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>