227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2449 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  80.24 
 
 
250 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.37 
 
 
249 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  72.18 
 
 
248 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  70.97 
 
 
250 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.77 
 
 
250 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  67.74 
 
 
250 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.63 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.23 
 
 
253 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.42 
 
 
253 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.59 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
251 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.19 
 
 
255 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.21 
 
 
249 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50 
 
 
255 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.62 
 
 
246 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.44 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.47 
 
 
256 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  40.08 
 
 
256 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.2 
 
 
241 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.31 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.29 
 
 
236 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.69 
 
 
241 aa  141  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.65 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.48 
 
 
239 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.33 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.8 
 
 
246 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.8 
 
 
246 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.89 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.74 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.77 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.07 
 
 
257 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.19 
 
 
251 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.4 
 
 
281 aa  118  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.08 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  30.59 
 
 
282 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.17 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.4 
 
 
467 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.4 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  34.43 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.33 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  32.79 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.72 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1178  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.72 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.814209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.04 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.31 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.77 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.54 
 
 
260 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0078  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.24 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.33 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.74 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2929  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.7 
 
 
251 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000223394  hitchhiker  0.00000900382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.6 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6463  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.27 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.59 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.88 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3486  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase- like protein  31.21 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.32 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
296 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.68 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1096  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.1 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223987  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3495  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.33 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.18 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.08 
 
 
623 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.08 
 
 
623 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.34 
 
 
280 aa  48.5  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.979822  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0569  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.77 
 
 
227 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.43 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.86 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.88 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.58 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.19 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0237  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.05 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.49 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.6 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.26 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.29 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1744  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.36 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.54 
 
 
594 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0648  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
623 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00338315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0502  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.27 
 
 
623 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02734  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.51 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.94 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.73 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1700  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.84 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  38.36 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.58 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0161  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.3 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1170  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.27 
 
 
623 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.27 
 
 
623 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.94 
 
 
334 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.018608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.66 
 
 
245 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.66 
 
 
247 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30830  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.4 
 
 
265 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5315  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.86 
 
 
264 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565842  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0709  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.86 
 
 
229 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000121711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.12 
 
 
383 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>