223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4752 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  73.9 
 
 
249 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.89 
 
 
250 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.77 
 
 
248 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  71.77 
 
 
250 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.2 
 
 
250 aa  362  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.88 
 
 
250 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.06 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.66 
 
 
253 aa  242  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.25 
 
 
253 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.82 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.85 
 
 
246 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.82 
 
 
249 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.81 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.53 
 
 
249 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.72 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.52 
 
 
236 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.55 
 
 
258 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.2 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.55 
 
 
241 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  37.15 
 
 
256 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.55 
 
 
256 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.92 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  35.92 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.95 
 
 
241 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.21 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.24 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.39 
 
 
239 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.27 
 
 
258 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35 
 
 
257 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.58 
 
 
251 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.57 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.22 
 
 
255 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.87 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.53 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.22 
 
 
253 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  29.32 
 
 
282 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.74 
 
 
467 aa  96.3  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.56 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.9 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.9 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.15 
 
 
328 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.56 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0060  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.71 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.14 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.7 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  31.93 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.1 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  32.77 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6463  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.28 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.91 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.25 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.25 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0078  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.67 
 
 
232 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.25 
 
 
241 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.86 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.06 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.77 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.88 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.05 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.86 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.86 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4138  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.22 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.86 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0683  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.64 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.31 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.86 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2174  hypothetical protein  33.55 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.44 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1701  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.88 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0157713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0893  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.29 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  0.0736212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.4 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0858  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.86 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30830  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.38 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0787  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.86 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
623 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
623 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.96 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0658  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
611 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
623 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0502  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  34.91 
 
 
623 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0504  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  34.91 
 
 
623 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.91 
 
 
623 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.89 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0591  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
611 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.64 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0586  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.58 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0869814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0749  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.37 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.620418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0648  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  34.91 
 
 
623 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00338315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2746  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.01 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0585  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.85 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>