298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1349 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1349  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1793  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.76 
 
 
249 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2449  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.19 
 
 
250 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.58 
 
 
253 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1426  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.37 
 
 
250 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.267833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.07 
 
 
253 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.78 
 
 
253 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6538  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.44 
 
 
255 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7459  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.05 
 
 
251 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.21 
 
 
246 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.782544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2407  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.56 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.724875  normal  0.178587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.53 
 
 
248 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3044  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.15 
 
 
250 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3314  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.53 
 
 
249 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36538  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2320  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.25 
 
 
249 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4752  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.72 
 
 
250 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.57 
 
 
236 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.75 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585017  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2532  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.11 
 
 
241 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.52 
 
 
258 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2026  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.86 
 
 
241 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.353201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1773  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.11 
 
 
239 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747849  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1166  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.52 
 
 
246 aa  158  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.640174  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1123  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  38.52 
 
 
246 aa  158  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.34942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2203  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.93 
 
 
246 aa  148  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.27 
 
 
251 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.11 
 
 
241 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2554  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.76 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.28 
 
 
255 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0895  phosphodiesterase-like  38.96 
 
 
256 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0136  cytosolic glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.55 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.55 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35 
 
 
257 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2476  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.35 
 
 
258 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.650377  normal  0.0557438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  29.32 
 
 
282 aa  121  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 
281 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0289  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.99 
 
 
467 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000460879  normal  0.30528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.92 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.879557  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1587  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.06 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0444  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.13 
 
 
220 aa  72  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.517917  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.12 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0328  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.47 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.710358 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.61 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.16 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1397  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.85 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0662  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.28 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0956645  normal  0.017312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1364  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.24 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000643821  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2737  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.89 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  decreased coverage  0.00114829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30830  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.15 
 
 
265 aa  62.4  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.68 
 
 
219 aa  62.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.028695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.11 
 
 
233 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1700  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.14 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02535  glycerophosphodiester phosphodiesterase  37.17 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0617  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  22.82 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111273  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1744  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.28 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3042  hypothetical protein  29.14 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.24 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0949  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.33 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.886696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.5 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.97 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1359  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.96 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.75 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000224371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2900  hypothetical protein  28.65 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.53 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6463  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.45 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  32.03 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111179  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1000  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.21 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0943134  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.48 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.03 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1096  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.99 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223987  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5255  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.4 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.49 
 
 
623 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.49 
 
 
623 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.72 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0078  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.17 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1999  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.17 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02734  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.9 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.52 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.52 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.83 
 
 
632 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000139686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.52 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.27 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.52 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3036  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.48 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1559  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.2 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.136192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.39 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2174  hypothetical protein  29.3 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  41.1 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.49 
 
 
623 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.29 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0543  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.53 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  30.59 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4138  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.75 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1882  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.62 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000161512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.57 
 
 
631 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.25 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.93 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  40.18 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.8 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3412  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.73 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>