228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5091 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  72.12 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  75.46 
 
 
163 aa  244  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  72.73 
 
 
163 aa  243  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 
163 aa  237  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  72.56 
 
 
164 aa  236  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  71.17 
 
 
163 aa  234  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 
179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 
179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 
179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  72.39 
 
 
162 aa  228  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  68.1 
 
 
163 aa  227  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  67.48 
 
 
163 aa  226  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  65.64 
 
 
163 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  66.47 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  66.27 
 
 
165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  67.28 
 
 
163 aa  217  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  64.85 
 
 
164 aa  216  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  66.26 
 
 
163 aa  213  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  67.48 
 
 
163 aa  213  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  63.64 
 
 
164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  64.63 
 
 
164 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  61.59 
 
 
165 aa  206  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  61.35 
 
 
163 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  63.64 
 
 
163 aa  205  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  65 
 
 
159 aa  204  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  61.96 
 
 
163 aa  201  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  64.42 
 
 
162 aa  201  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  63.25 
 
 
163 aa  192  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  57.67 
 
 
164 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  60.74 
 
 
162 aa  191  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  63.25 
 
 
163 aa  191  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  63.86 
 
 
162 aa  190  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
162 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  58.33 
 
 
167 aa  180  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  46.67 
 
 
163 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  46.67 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
162 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  47.27 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
162 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  130  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  44.31 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  44.31 
 
 
165 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  44.91 
 
 
165 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  43.71 
 
 
165 aa  123  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  43.11 
 
 
165 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  43.71 
 
 
165 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
166 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  44.31 
 
 
165 aa  121  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  43.71 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  41.61 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  43.37 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
165 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  43.98 
 
 
165 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  43.11 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  43.98 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  41.92 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  42.51 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  41.92 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
163 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
163 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  39.75 
 
 
163 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>