228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3127 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  315  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  65.24 
 
 
166 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  63.19 
 
 
164 aa  209  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 
165 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
163 aa  197  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  60.74 
 
 
163 aa  197  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  60.38 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  60.74 
 
 
163 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  60.74 
 
 
163 aa  193  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  61.01 
 
 
161 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  60.38 
 
 
161 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  59.75 
 
 
161 aa  191  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  61.01 
 
 
161 aa  189  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  60.12 
 
 
163 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  61.01 
 
 
161 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  55.83 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
163 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  59.75 
 
 
161 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  59.12 
 
 
161 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 
164 aa  184  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  55.56 
 
 
164 aa  171  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  52.2 
 
 
161 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  52.2 
 
 
161 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  52.83 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  49.06 
 
 
160 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  51.57 
 
 
161 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  51.57 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  52.2 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  50.94 
 
 
159 aa  150  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  47.24 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  52.2 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  46.67 
 
 
165 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  49.09 
 
 
163 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
164 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  47.88 
 
 
165 aa  148  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  51.57 
 
 
161 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
163 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
164 aa  147  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  49.06 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  49.06 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  48.48 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  46.3 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  48.77 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  49.07 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  50 
 
 
163 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
163 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
163 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
163 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  48.43 
 
 
161 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  48.43 
 
 
161 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
165 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  48.78 
 
 
162 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
162 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  47.17 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  50.94 
 
 
161 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 
161 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 
161 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
165 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  46.3 
 
 
163 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  44.24 
 
 
165 aa  141  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  47.9 
 
 
167 aa  141  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  47.8 
 
 
161 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  50.3 
 
 
165 aa  141  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  47.83 
 
 
163 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
163 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 
161 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>