228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0858 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  100 
 
 
163 aa  320  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  72.73 
 
 
165 aa  243  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  69.33 
 
 
163 aa  233  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  70.37 
 
 
163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  68.52 
 
 
163 aa  227  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  69.09 
 
 
165 aa  225  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  67.08 
 
 
162 aa  224  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  67.48 
 
 
164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  64.85 
 
 
165 aa  221  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  65.64 
 
 
164 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  66.05 
 
 
163 aa  220  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  70.12 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  68.9 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  66.04 
 
 
159 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  67.07 
 
 
167 aa  217  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  64.81 
 
 
163 aa  216  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  65.43 
 
 
163 aa  215  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  62.96 
 
 
163 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  62.96 
 
 
163 aa  214  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  64.2 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  64.2 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  64.2 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  68.9 
 
 
162 aa  210  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  65.43 
 
 
163 aa  209  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  61.59 
 
 
165 aa  208  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  61.59 
 
 
164 aa  207  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  60.37 
 
 
164 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  62.96 
 
 
163 aa  200  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  58.02 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  62.87 
 
 
167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  60.87 
 
 
162 aa  197  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  59.26 
 
 
163 aa  196  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 
162 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  55.56 
 
 
164 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  54.94 
 
 
163 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
162 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  48.48 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  43.04 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.9 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  43.37 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  43.29 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 
160 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  43.37 
 
 
165 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  39.62 
 
 
160 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  46.39 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.03 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 
161 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  41.77 
 
 
160 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  40.85 
 
 
164 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  38.36 
 
 
160 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  42.17 
 
 
165 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  37.34 
 
 
160 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
161 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  41.51 
 
 
161 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  42.14 
 
 
161 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
165 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  40.24 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  41.46 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  41.57 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  42.68 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  38.36 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  45.18 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  42.07 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  42.17 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  41.46 
 
 
163 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  41.51 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  37.11 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  40.74 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
161 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  40.88 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  40.85 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>