230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0477 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
164 aa  328  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  95.12 
 
 
164 aa  316  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  73.46 
 
 
163 aa  249  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  72.84 
 
 
163 aa  248  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  72.22 
 
 
163 aa  241  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  70.99 
 
 
164 aa  238  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  70.37 
 
 
163 aa  237  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  67.9 
 
 
163 aa  234  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  69.75 
 
 
163 aa  233  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  67.28 
 
 
163 aa  228  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
179 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
179 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
179 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
163 aa  223  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  68.52 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  64.81 
 
 
163 aa  217  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  63.64 
 
 
165 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  63.58 
 
 
163 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  67.28 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  63.64 
 
 
165 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  60.12 
 
 
164 aa  205  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  59.88 
 
 
163 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  62.2 
 
 
164 aa  202  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  60.37 
 
 
163 aa  202  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  63.58 
 
 
162 aa  201  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  58.68 
 
 
167 aa  200  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  58.49 
 
 
163 aa  198  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  57.83 
 
 
165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  57.32 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  61.82 
 
 
162 aa  194  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  56.71 
 
 
165 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  58.02 
 
 
162 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  58.18 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  57.58 
 
 
163 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  56.25 
 
 
159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  51.79 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  53.01 
 
 
164 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  49.69 
 
 
164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
163 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  47.5 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
161 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
161 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
160 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
160 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
161 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
161 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
166 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  47.88 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  137  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  49.09 
 
 
163 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  44.58 
 
 
165 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
164 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  45.62 
 
 
160 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  43.98 
 
 
165 aa  130  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>