228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3204 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  313  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 
161 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  81.99 
 
 
161 aa  267  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  80.12 
 
 
161 aa  264  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  79.38 
 
 
161 aa  258  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  75.62 
 
 
161 aa  245  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  76.25 
 
 
161 aa  245  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  68.75 
 
 
161 aa  214  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  60.38 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  193  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  57.59 
 
 
165 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  56.33 
 
 
164 aa  187  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  56.96 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 
163 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  56.6 
 
 
166 aa  180  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  57.59 
 
 
163 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  55.56 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  55.56 
 
 
163 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  176  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  50.31 
 
 
161 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  50.31 
 
 
161 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  54.37 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
162 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  157  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
162 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  51.25 
 
 
164 aa  152  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  53.12 
 
 
162 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
159 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
162 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
162 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  148  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
160 aa  147  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
162 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
172 aa  147  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  45.62 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  47.85 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  48.75 
 
 
165 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
159 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  50.31 
 
 
165 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 
163 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  47.2 
 
 
159 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  48.15 
 
 
167 aa  141  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
165 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
161 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  48.12 
 
 
163 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  141  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  46.88 
 
 
165 aa  140  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  140  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  48.75 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  47.56 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>