228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2177 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  180  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
160 aa  161  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  157  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
160 aa  157  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  45.34 
 
 
160 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
159 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
160 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  45.96 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  45.96 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
161 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
161 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
160 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
161 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
161 aa  148  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  46.88 
 
 
165 aa  147  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  48.73 
 
 
164 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
160 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
160 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  44.44 
 
 
168 aa  144  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
161 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  46.25 
 
 
165 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
160 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
159 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
163 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
161 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  44.1 
 
 
161 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  44.1 
 
 
161 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 
163 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 
163 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  43.04 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  43.83 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 
163 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
162 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>