228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1596 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  314  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  87.73 
 
 
163 aa  287  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  76.4 
 
 
161 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  75.78 
 
 
161 aa  250  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  77.02 
 
 
161 aa  250  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  75.16 
 
 
161 aa  248  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  73.29 
 
 
161 aa  244  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  241  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  70.81 
 
 
161 aa  235  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  74.07 
 
 
162 aa  234  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  59.01 
 
 
161 aa  195  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 
161 aa  193  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  59.01 
 
 
161 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 
161 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  61.73 
 
 
168 aa  191  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 
161 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
161 aa  183  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
161 aa  177  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  54.66 
 
 
161 aa  177  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
160 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  59.01 
 
 
161 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  54.04 
 
 
161 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
161 aa  174  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  173  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  54.88 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  52.44 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  158  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
160 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
163 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  47.2 
 
 
160 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
160 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  45.96 
 
 
161 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  45.96 
 
 
161 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  146  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
163 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  143  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
163 aa  143  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
160 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
161 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  140  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
159 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
161 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
159 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  140  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  44.3 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
161 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  47.24 
 
 
161 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 
163 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>