230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1091 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  176  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  54.43 
 
 
164 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  51.57 
 
 
166 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  173  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  173  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
160 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  55.21 
 
 
161 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 
161 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  52.2 
 
 
163 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  49.37 
 
 
165 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
159 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
161 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
159 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 
163 aa  157  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
160 aa  157  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  46.2 
 
 
163 aa  157  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  49.69 
 
 
159 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
160 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
159 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 
163 aa  154  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
159 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  46.84 
 
 
163 aa  154  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  45.62 
 
 
164 aa  153  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  47.47 
 
 
164 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 
160 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
161 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  45.57 
 
 
163 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
163 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
163 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
163 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  45.57 
 
 
163 aa  151  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  45.57 
 
 
163 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  45.57 
 
 
163 aa  150  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 
163 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
163 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>