228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2254 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  63.75 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  57.5 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  54.37 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  56.79 
 
 		 161 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 		 161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  51.25 
 
 		 160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  55 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  55 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  55.62 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  52.5 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  55.62 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  52.5 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 		 172 aa  173  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  53.75 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  53.75 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  53.09 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  50.62 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  47.83 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  47.83 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  48.45 
 
 		 161 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  48.45 
 
 		 161 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 		 163 aa  157  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  48.73 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  48.12 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  47.88 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>