228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1670 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  193  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  59.63 
 
 
161 aa  193  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 
161 aa  192  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  54.04 
 
 
161 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  54.04 
 
 
161 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  59.38 
 
 
161 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  61.11 
 
 
163 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  183  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  57.5 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  56.88 
 
 
161 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  180  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  55.62 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  55.7 
 
 
164 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
161 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  173  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
160 aa  173  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  53.42 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  54.09 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
160 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  169  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
161 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  55.9 
 
 
161 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  51.55 
 
 
161 aa  168  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
159 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 
161 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  54.27 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  54.32 
 
 
168 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
163 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
159 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
164 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
159 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  54.27 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 
161 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
161 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  54.94 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
163 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
161 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 
172 aa  164  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  52.17 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  52.83 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  163  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 
161 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  160  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
163 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  53.8 
 
 
163 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
161 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  48.47 
 
 
160 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  53.16 
 
 
163 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
162 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  49.37 
 
 
163 aa  157  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  52.53 
 
 
163 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  51.27 
 
 
163 aa  155  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  52.15 
 
 
161 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>