228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1191 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  76.54 
 
 		 163 aa  263  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 		 163 aa  236  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  63.58 
 
 		 163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  48.15 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 		 163 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  46.01 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  46.01 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  43.48 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  44.1 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40.49 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  40.49 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 165 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 163 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 172 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  40.49 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  39.88 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  40.37 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  42.07 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  42.33 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  39.26 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  39.88 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  41.72 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0732  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>