228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4781 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  87.58 
 
 
161 aa  285  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  86.96 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  83.23 
 
 
161 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  80.75 
 
 
161 aa  261  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  80.12 
 
 
161 aa  258  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  76.4 
 
 
161 aa  255  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  75.31 
 
 
162 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  73.91 
 
 
161 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  73.62 
 
 
163 aa  233  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  68.94 
 
 
161 aa  229  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  67.08 
 
 
161 aa  227  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  66.46 
 
 
161 aa  227  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  64.6 
 
 
161 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 
161 aa  217  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  67.28 
 
 
168 aa  216  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 
161 aa  215  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 
161 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 
161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  62.11 
 
 
161 aa  210  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  60.87 
 
 
161 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 
161 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 
161 aa  203  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  63.35 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 
161 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 
161 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 
161 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  58.39 
 
 
161 aa  191  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
161 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  55.28 
 
 
161 aa  186  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  55.49 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  56.71 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
161 aa  173  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
161 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
160 aa  167  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  51.55 
 
 
160 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
161 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
160 aa  163  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  52.76 
 
 
163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
160 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
163 aa  157  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
160 aa  157  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
163 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
163 aa  153  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
163 aa  153  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
163 aa  153  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  52.8 
 
 
159 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
160 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
159 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
159 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  43.48 
 
 
161 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
161 aa  151  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
163 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  53.37 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  51.53 
 
 
161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
160 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>