228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2474 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
161 aa  314  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  99.38 
 
 
161 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  98.14 
 
 
161 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  91.3 
 
 
161 aa  298  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  90.68 
 
 
161 aa  297  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  87.58 
 
 
161 aa  288  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  86.96 
 
 
161 aa  285  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2579  putative nucleotide-binding protein  96.89 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1944  putative nucleotide-binding protein  96.89 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.478874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2555  putative nucleotide-binding protein  96.89 
 
 
161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0741  putative nucleotide-binding protein  96.27 
 
 
161 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  85.09 
 
 
161 aa  279  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0527  putative nucleotide-binding protein  93.79 
 
 
161 aa  277  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.487699  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  88.82 
 
 
161 aa  275  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  83.85 
 
 
161 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  88.2 
 
 
161 aa  273  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  81.99 
 
 
161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  72.67 
 
 
161 aa  241  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  73.29 
 
 
161 aa  241  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  67.28 
 
 
168 aa  225  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  67.08 
 
 
161 aa  223  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  68.94 
 
 
161 aa  220  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3039  hypothetical protein  66.05 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  64.6 
 
 
161 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2240  putative nucleotide-binding protein  65.84 
 
 
161 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.065474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  63.98 
 
 
161 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2750  putative nucleotide-binding protein  65.22 
 
 
161 aa  215  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821102  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  62.11 
 
 
161 aa  213  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3464  putative nucleotide-binding protein  62.73 
 
 
161 aa  212  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32342  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  64.6 
 
 
161 aa  209  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1596  putative nucleotide-binding protein  59.01 
 
 
161 aa  195  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 
161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1080  putative nucleotide-binding protein  58.28 
 
 
163 aa  187  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240554  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 
160 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  54.66 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1706  putative nucleotide-binding protein  53.05 
 
 
164 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.280602  hitchhiker  0.00217335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3028  putative nucleotide-binding protein  53.05 
 
 
164 aa  171  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.208181  normal  0.91414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  54.04 
 
 
160 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  53.42 
 
 
160 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  53.16 
 
 
164 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  49.07 
 
 
161 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  49.07 
 
 
161 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  50.93 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  163  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  52.2 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
161 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 
160 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  51.55 
 
 
160 aa  157  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
160 aa  156  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  47.2 
 
 
160 aa  156  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
160 aa  156  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  156  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
160 aa  155  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  51.57 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1902  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  154  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3443  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000233798  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3646  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.507653  normal  0.0694826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  51.88 
 
 
163 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3532  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3724  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3601  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0710  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3114  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
160 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
162 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0770  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
161 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000279998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  52.17 
 
 
159 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 
160 aa  147  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  147  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
162 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
172 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>