228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  327  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  75.15 
 
 
165 aa  252  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  70.3 
 
 
165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07510  hypothetical protein  61.82 
 
 
165 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  49.09 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  49.09 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
166 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 
163 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  49.4 
 
 
165 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  140  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  47.83 
 
 
163 aa  140  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  47.24 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  42.5 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  42.5 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 
163 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  46.88 
 
 
161 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  46.63 
 
 
163 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  46.34 
 
 
164 aa  136  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  48.21 
 
 
167 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  50.9 
 
 
162 aa  136  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  44.58 
 
 
164 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  48.8 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  43.37 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  44.79 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  47.59 
 
 
163 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  46.99 
 
 
163 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
163 aa  131  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
163 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
163 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  44.31 
 
 
165 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  45.4 
 
 
163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  43.56 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  44.71 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  43.71 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
163 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
172 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>