228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10576 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  87.12 
 
 
163 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  82.21 
 
 
163 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  73.62 
 
 
163 aa  248  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  72.39 
 
 
163 aa  246  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  70.55 
 
 
163 aa  241  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  71.78 
 
 
164 aa  234  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  68.1 
 
 
163 aa  234  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  68.1 
 
 
163 aa  233  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  66.87 
 
 
163 aa  231  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  66.87 
 
 
163 aa  231  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  65.64 
 
 
163 aa  228  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  68.1 
 
 
162 aa  227  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  68.48 
 
 
164 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  66.26 
 
 
165 aa  224  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
164 aa  224  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  66.67 
 
 
164 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  65.64 
 
 
165 aa  221  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  64.85 
 
 
167 aa  218  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  64.02 
 
 
165 aa  216  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  62.96 
 
 
163 aa  215  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  65.64 
 
 
162 aa  214  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  62.8 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  62.35 
 
 
163 aa  213  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  62.42 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  64.38 
 
 
159 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 
163 aa  202  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  61.35 
 
 
162 aa  198  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  60.49 
 
 
162 aa  194  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  59.51 
 
 
163 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 
163 aa  187  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  59.04 
 
 
167 aa  184  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 
162 aa  183  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  52.76 
 
 
164 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
163 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  46.95 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  50.92 
 
 
163 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 
161 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
166 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 
163 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 
161 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
163 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  49.08 
 
 
163 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
163 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  45.68 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  45.28 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3156  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0811  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  44.65 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
160 aa  131  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  44.85 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  42.5 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  43.03 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
162 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  44.24 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
161 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
163 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  40.88 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  44.79 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>