228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0558 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 162 aa  321  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  85.8 
 
 		 162 aa  280  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  67.9 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  67.28 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  61.73 
 
 		 162 aa  207  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  63.19 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  61.73 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  62.2 
 
 		 164 aa  203  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  61.35 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  61.35 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  60.37 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  60.74 
 
 		 163 aa  200  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  61.35 
 
 		 163 aa  200  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  58.28 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  57.14 
 
 		 163 aa  194  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  58.79 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  58.28 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  58.28 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  58.28 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 		 165 aa  189  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  57.67 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  57.67 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  55.21 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 163 aa  183  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 		 163 aa  183  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  55.15 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  55.21 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  54.72 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  55.15 
 
 		 167 aa  176  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  56.79 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  53.42 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  52.15 
 
 		 163 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  54.37 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  54.37 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  54.37 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  53.12 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  53.75 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  51.25 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  52.5 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  49.69 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  51.88 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  47.24 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  47.8 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  45.91 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  47.83 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  44.24 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  46.63 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  46.54 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  45.28 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  44.79 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  43.12 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  43.12 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  43.12 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1169  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1175  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  42.14 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1115  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  43.4 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  42.14 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2557  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.317915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  44.85 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  40.88 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  42.68 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>