228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0784 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  70.3 
 
 		 165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  67.27 
 
 		 165 aa  221  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07510  hypothetical protein  60.61 
 
 		 165 aa  203  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  50.91 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  49.4 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  48.48 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  46.25 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  46.25 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  47.9 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  45.62 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  50.3 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  45 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 		 163 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  49.69 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  49.08 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  47.83 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  49.08 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.88 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  41.92 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003420  protein yajQ  41.88 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  41.92 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  46.34 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  46.01 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  47.59 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  47.62 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  45.4 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  48.19 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>