228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0481 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
165 aa  320  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  91.52 
 
 
165 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  91.52 
 
 
165 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  80.61 
 
 
165 aa  263  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  54.55 
 
 
165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  55.76 
 
 
165 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 
176 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  54.55 
 
 
165 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  55.76 
 
 
163 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  53.33 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  56.36 
 
 
163 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  52.73 
 
 
163 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  52.73 
 
 
165 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  52.12 
 
 
165 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  46.67 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  46.67 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  50.91 
 
 
164 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  49.7 
 
 
163 aa  171  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  45.45 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  40.62 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  39.76 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  43.11 
 
 
165 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  45.51 
 
 
163 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  42.77 
 
 
163 aa  120  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  44.91 
 
 
163 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  43.71 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  41.57 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  41.57 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  44.91 
 
 
163 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  40.96 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  35.15 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  41.32 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
164 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  40.12 
 
 
165 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
160 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  39.38 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  40.72 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  40.72 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3769  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  40.72 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  40.96 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  41.92 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  44.05 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
161 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  35 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
161 aa  111  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  35.93 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  35 
 
 
161 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  38.55 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1242  hypothetical protein  38.51 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.1131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  39.52 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  33.12 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  36.53 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  38.32 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  38.92 
 
 
163 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  35.33 
 
 
163 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  38.1 
 
 
167 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  36.25 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  36.88 
 
 
159 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4781  putative nucleotide-binding protein  35.62 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0520927  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  39.29 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  35.15 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  38.32 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  37.72 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2692  putative nucleotide-binding protein  33.75 
 
 
161 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  35.93 
 
 
163 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  35 
 
 
161 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  39.16 
 
 
162 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>