228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0530 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  331  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  93.33 
 
 		 165 aa  315  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  63.8 
 
 		 164 aa  220  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  63.64 
 
 		 165 aa  217  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  56.97 
 
 		 163 aa  197  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  55.15 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  58.18 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  54.55 
 
 		 165 aa  190  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  54.55 
 
 		 163 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  53.33 
 
 		 163 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  50.3 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  49.7 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  51.52 
 
 		 163 aa  179  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  49.09 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 		 165 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  47.88 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  47.27 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  42.17 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  48.17 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  44.91 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  44.31 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  44.31 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  42.17 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  44.05 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  43.71 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  44.31 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  40.61 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40.61 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  44.58 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  45.24 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  44.85 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  43.71 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  41.92 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  44.58 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  35.76 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  44.24 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  43.71 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  35.15 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  42.17 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  42.68 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 179 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  41.92 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  33.94 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  41.92 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  45.18 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  41.21 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  42.68 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  42.51 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  42.77 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  41.67 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  41.92 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  38.18 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>