228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3073 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  95.09 
 
 		 163 aa  311  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  80.25 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  71.52 
 
 		 165 aa  235  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  71.34 
 
 		 163 aa  232  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  69.94 
 
 		 164 aa  223  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  66.47 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  68.9 
 
 		 163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07620  hypothetical protein  67.5 
 
 		 159 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0480829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  66.67 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  66.67 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  63.1 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0561  protein of unknown function DUF520  62.58 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.637028  normal  0.064143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  63.98 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  61.21 
 
 		 165 aa  200  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  63.25 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  60.25 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  61.11 
 
 		 164 aa  190  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  57.58 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  58.9 
 
 		 163 aa  187  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  59.26 
 
 		 163 aa  187  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  57.58 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  58.64 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  57.76 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  60.49 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  56.63 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  58.64 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0286  putative nucleotide-binding protein  58.02 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5248  putative nucleotide-binding protein  58.02 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  55.28 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  54.94 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  56.52 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  55.21 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  53.7 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  48.48 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  45.78 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  51.2 
 
 		 165 aa  140  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  45.18 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  45.73 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  45.73 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  46.71 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.75 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  44.91 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  47.59 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  48.43 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  48.12 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  43.04 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  46.88 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  43.64 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 		 163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  41.57 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  42.68 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2261  putative nucleotide-binding protein  40.25 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  48.19 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3815  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  43.29 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  39.24 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>