90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2102 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2102  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  100 
 
 
214 aa  435  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1083  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  32.62 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1223  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  31.18 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.849201  normal  0.519405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0515  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.57 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0229032  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3216  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.64 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0364  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  29.5 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0392216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0874  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.5 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0540  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  27.1 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2713  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.78 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00369831  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1446  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  30.33 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1291  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.98 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.180608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1492  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  35.54 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1239  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  27.45 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1433  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  27.45 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0756043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2092  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  26.89 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0699  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  27.72 
 
 
195 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0704  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  28.46 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0473  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.5 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.871662  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  26.21 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.61 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530041  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1716  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.86 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1492  putative precorrin-6y methylase  21.31 
 
 
421 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0627  cobalt-factor II C20-methyltransferase / precorrin-4 C11-methyltransferase  26.85 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1010  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  26.2 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  25.56 
 
 
614 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  24.77 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0694  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.23 
 
 
247 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210241  hitchhiker  0.0000263723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.29 
 
 
626 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0693  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  25.44 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.152169  hitchhiker  0.0000247866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1706  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.88 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0210  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  30.43 
 
 
437 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1887  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.65 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0177135  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3168  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.11 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.31 
 
 
470 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1089  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  26.98 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.340083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  24.52 
 
 
258 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.75 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  21.66 
 
 
473 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  28.97 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04601  precorrin-4 C11-methyltransferase  27.34 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.909229  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  28.8 
 
 
517 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  21.66 
 
 
470 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  21.66 
 
 
473 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0251  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.24 
 
 
490 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2373  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase, putative  29.09 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0960  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  27.88 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000105238  normal  0.505565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.58 
 
 
463 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1718  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  28.43 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0005  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiE  25.35 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.75 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  23.04 
 
 
459 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3179  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.85 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.62 
 
 
482 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0051  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  24.88 
 
 
412 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0905  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.96 
 
 
269 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  27.01 
 
 
468 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.58 
 
 
463 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.33 
 
 
293 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0146  precorrin-4 C11-methyltransferase  32.29 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.448492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  28.91 
 
 
596 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0476  precorrin-2 C20-methyltransferase  25.33 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0806  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  29.03 
 
 
273 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2359  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  29.32 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  31.54 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  26.01 
 
 
626 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  25 
 
 
474 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  26.43 
 
 
526 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06621  putative precorrin-4 C11-methyltransferase  29.03 
 
 
251 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  27.78 
 
 
264 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0917  putative precorrin-6y methylase  20.54 
 
 
419 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.858759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  23.89 
 
 
467 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2657  precorrin-2 C20-methyltransferase, putative  34.07 
 
 
222 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  25.22 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  23.04 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  22.9 
 
 
457 aa  42  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.32 
 
 
458 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  22.58 
 
 
459 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2375  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.46 
 
 
507 aa  41.6  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.656731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1722  cobalt-precorrin-2 C(20)-methyltransferase  28.57 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.63 
 
 
263 aa  41.6  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1528  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  31.33 
 
 
211 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00214205 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3310  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  27.43 
 
 
249 aa  41.6  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.198523  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.48 
 
 
484 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>