63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8366 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8366  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2709  Rieske (2Fe-2S) domain protein  75.7 
 
 		 123 aa  186  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  35.64 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.22 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  28.45 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  35.16 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  32.22 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.41 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 		 521 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.02 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.73 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.73 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32.26 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  27.17 
 
 		 599 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.43 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  29.47 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.07 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  27.27 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.32 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  31.07 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  23.93 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.12 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.88 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  35.82 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  30.93 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.38 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 649 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.4 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  21.78 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  23.68 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  31.18 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  27.27 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.5 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  28.87 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.97 
 
 		 110 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.12 
 
 		 112 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  38.6 
 
 		 109 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.37 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21930  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.7 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30.3 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  31.43 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 		 644 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  27.03 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 		 118 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>