55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3836 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  776    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  43.5 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  43.51 
 
 
367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  43.24 
 
 
371 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  51.24 
 
 
303 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  39.35 
 
 
371 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  40.37 
 
 
371 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  38.22 
 
 
369 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  36.04 
 
 
369 aa  248  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  35.5 
 
 
359 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.75 
 
 
368 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  35.59 
 
 
423 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  34.52 
 
 
364 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.52 
 
 
365 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  35.01 
 
 
366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  35.12 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  35.64 
 
 
369 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  38.19 
 
 
370 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  32.26 
 
 
367 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  32.75 
 
 
367 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  34.04 
 
 
372 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  37.4 
 
 
256 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  37.1 
 
 
256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  36.69 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  37.1 
 
 
256 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  36.69 
 
 
256 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  36.69 
 
 
256 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  36.82 
 
 
266 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  36.22 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.2 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  32.75 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  31.74 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  31.61 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  27.75 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  27.36 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2174  3-methylpurine-DNA glycosylase  32.64 
 
 
147 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  30.41 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  30.59 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  28.57 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  29.6 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  33.05 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  37.23 
 
 
199 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  41.38 
 
 
210 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  35.79 
 
 
209 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  26.84 
 
 
260 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  36.78 
 
 
206 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  38.2 
 
 
210 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2509  hypothetical protein  44.44 
 
 
74 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242826  normal  0.108151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  27.89 
 
 
254 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  32.97 
 
 
254 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>