54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2485 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  48.15 
 
 
279 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  43.22 
 
 
258 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  42.42 
 
 
287 aa  216  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  43.18 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  41.13 
 
 
258 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  41.89 
 
 
253 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  39.05 
 
 
258 aa  208  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  40.68 
 
 
279 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  40.56 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  39.22 
 
 
259 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  36.84 
 
 
260 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  40.57 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  38.34 
 
 
248 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  37.2 
 
 
254 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  37.6 
 
 
254 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  39.29 
 
 
254 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  40.3 
 
 
367 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.14 
 
 
368 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  37.5 
 
 
423 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  41.67 
 
 
359 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  37.86 
 
 
365 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  40 
 
 
367 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  37.6 
 
 
369 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  42.5 
 
 
366 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  36 
 
 
373 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  34.17 
 
 
370 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  40.83 
 
 
364 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  36.21 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  34.17 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  34.45 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  26.32 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  29.6 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  29.17 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  31.67 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  35.16 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  35.16 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  29.58 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  35.16 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  34.38 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  35.16 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  35.16 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  34.38 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  31.67 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  31.47 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  28.06 
 
 
209 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  34.95 
 
 
372 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  30.72 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  32.94 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0290  hypothetical protein  56.82 
 
 
94 aa  52.4  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.297512  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  26.45 
 
 
199 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  33 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  29.47 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>