41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1843 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  64.56 
 
 
206 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  48.68 
 
 
209 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  49.47 
 
 
199 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  56.17 
 
 
210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  39.8 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  40.23 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  34.86 
 
 
367 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  34.07 
 
 
366 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  33.33 
 
 
368 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  32.2 
 
 
364 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  33.75 
 
 
367 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  33.33 
 
 
365 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  26.79 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  37.93 
 
 
367 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  34.07 
 
 
359 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  25.87 
 
 
279 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  32.5 
 
 
371 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  38.16 
 
 
383 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  31.82 
 
 
373 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  35.9 
 
 
423 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  28.83 
 
 
248 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  36.25 
 
 
369 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  31.58 
 
 
371 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  32.18 
 
 
371 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  30.85 
 
 
303 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  33 
 
 
267 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  34.12 
 
 
256 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  30.68 
 
 
258 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  28.12 
 
 
372 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  25.3 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  31.25 
 
 
370 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  26.92 
 
 
245 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  26.43 
 
 
258 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  32.53 
 
 
256 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>