38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1000 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  54.12 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  49.75 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  56.17 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  47.72 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  41.79 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  41.38 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  37.25 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  35.92 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  35.23 
 
 		 373 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  32.67 
 
 		 368 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  33.01 
 
 		 359 aa  52  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  38.46 
 
 		 369 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  30.94 
 
 		 364 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  32.1 
 
 		 371 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  30.63 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  34.48 
 
 		 366 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  34.44 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  32.1 
 
 		 367 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  33.7 
 
 		 369 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  29.47 
 
 		 267 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  29.17 
 
 		 371 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  31.03 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  35.29 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  29.09 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  32.67 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  32.22 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  33.72 
 
 		 287 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 318 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  30 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  31.03 
 
 		 371 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  36.14 
 
 		 383 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>