40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1292 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  54.12 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  47.42 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  49.47 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  42.64 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  45.69 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  37.23 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  30.19 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  36.79 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  34.74 
 
 		 365 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  34.48 
 
 		 367 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  25.16 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  29.55 
 
 		 373 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  29.86 
 
 		 364 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 		 371 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  27.45 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  32.18 
 
 		 371 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  28 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  31.91 
 
 		 366 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  31.03 
 
 		 359 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  29.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  30.59 
 
 		 367 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  30.77 
 
 		 371 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  29.89 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  26.45 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  23.81 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  32.53 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  32.05 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  29.49 
 
 		 423 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  32.5 
 
 		 256 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  29.89 
 
 		 256 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  26.47 
 
 		 279 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  24.42 
 
 		 287 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  28.26 
 
 		 369 aa  41.2  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>