52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4012 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  100 
 
 		 423 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  54.82 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  50.27 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  53.33 
 
 		 370 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  41.39 
 
 		 367 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  40.27 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  35.59 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  41.21 
 
 		 383 aa  223  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  40 
 
 		 303 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  42.54 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  38.82 
 
 		 371 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  36.36 
 
 		 366 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  37.9 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  38.85 
 
 		 365 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  35.77 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  38.11 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  34.98 
 
 		 364 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  31.27 
 
 		 369 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  29.91 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  29.62 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  36.25 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  32.56 
 
 		 256 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  42.22 
 
 		 266 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  28.45 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  28.69 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  45.67 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  37.5 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  46.61 
 
 		 258 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  41.73 
 
 		 287 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  33.61 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  42.37 
 
 		 256 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  36.08 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  43.22 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  44.17 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  39.83 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  40.83 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  38.79 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  41.84 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  34.71 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  40.7 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  35.9 
 
 		 206 aa  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  37.18 
 
 		 209 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  36.08 
 
 		 254 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  37.36 
 
 		 254 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1000  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  29.49 
 
 		 199 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>