53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2110 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  760    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  43.5 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  44.12 
 
 		 371 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  43.85 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  41.53 
 
 		 371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  47.99 
 
 		 303 aa  263  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  39.73 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  42.15 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  41.21 
 
 		 423 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  38.93 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  42.16 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  34.05 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  32.61 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  31.9 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  31.35 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  36.69 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  33.08 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  33.7 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  32.08 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  36.77 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  35.89 
 
 		 256 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  35.89 
 
 		 256 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  36.84 
 
 		 256 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  36.44 
 
 		 256 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  36.18 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  35.48 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  35.51 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  38.71 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  43.22 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  41.88 
 
 		 245 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  38.1 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  38.85 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  32.69 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2174  3-methylpurine-DNA glycosylase  27.21 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  36.3 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  36.07 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  31.67 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  31.9 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  30.6 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  29.71 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  39.81 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  37.7 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  33.07 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  32.43 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  34.19 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  35.77 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2509  hypothetical protein  48.44 
 
 		 74 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242826  normal  0.108151 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1843  phosphomethylpyrimidine kinase  38.16 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0571  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  30.61 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1292  hypothetical protein  32.53 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00634869  normal  0.479491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>