49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1610 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  60.8 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  60.89 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  55.04 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  51.17 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  53.39 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  55.37 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  55.33 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  52.92 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  47.13 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  36.84 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  41.98 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.21 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  44.4 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  43.41 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  43.41 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  43.15 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  31.12 
 
 		 359 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  44.44 
 
 		 368 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  39.83 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  37.86 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  39.42 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  39.83 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  31.82 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  38.78 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  34.34 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  36.44 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  35.66 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  35.85 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  33.9 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  34.91 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  35.29 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  24.23 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  24.23 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  42.05 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  34.91 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  33.96 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  33.96 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  29.53 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  36.44 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  33.96 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  38.38 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  26.84 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  34.96 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  32.79 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  34.91 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  31.48 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>