50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4380 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  547  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2877  DNA alkylation repair enzyme-like protein  41.39 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0471  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.524799  normal  0.392705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2747  hypothetical protein  45.66 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105706  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3357  hypothetical protein  45.15 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2485  DNA alkylation repair enzyme-like protein  40.68 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00000423603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3654  hypothetical protein  46.77 
 
 		 261 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.114436  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2768  hypothetical protein  48.02 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4994  hypothetical protein  44.87 
 
 		 258 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5247  hypothetical protein  46.64 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.340096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2691  hypothetical protein  45.49 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0329762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1742  hypothetical protein  41.37 
 
 		 256 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1610  hypothetical protein  44.4 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3617  hypothetical protein  42.25 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2305  hypothetical protein  43.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3107  hypothetical protein  44.53 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3610  hypothetical protein  43.78 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.769514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4848  DNA alkylation repair enzyme-like protein  41.94 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4012  heat domain containing protein  45.67 
 
 		 423 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3330  DNA-3-methylpurine glycosylase  31.09 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1451  DNA alkylation repair enzyme-like protein  43.85 
 
 		 368 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2858  hypothetical protein  36.31 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0457294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1705  HEAT  40.32 
 
 		 359 aa  86.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0226919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2796  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2836  hypothetical protein  35.26 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3087  hypothetical protein  35.26 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3073  hypothetical protein  35.67 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3104  hypothetical protein  35.03 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2864  hypothetical protein  35.26 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3078  hypothetical protein  35.26 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.810568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33290  DNA alkylation repair enzyme  43.31 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3836  hypothetical protein  36.22 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.059186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1766  DNA-3-methylpurine glycosylase  36.89 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0802128  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3489  heat domain-containing protein  32.93 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3163  HEAT domain containing protein  34.12 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0046  putative DNA alkylation repair protein  39.37 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2895  HEAT domain containing protein  37.04 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3451  putative DNA alkylation repair protein  40.94 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2507  DNA-3-methylpurine glycosylase  34.55 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0480319  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5072  HEAT domain containing protein  34.43 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.946755  normal  0.336165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0150  putative DNA alkylation repair enzyme  33.33 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2110  hypothetical protein  36.3 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.498409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1337  heat shock protein  34.23 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4029  putative DNA alkylation repair enzyme  33.07 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2423  hypothetical protein  36.92 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0923024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3967  hypothetical protein  34.43 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2248  HEAT domain containing protein  37.27 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.642338  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1802  hypothetical protein  36.59 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  0.0113105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0290  hypothetical protein  43.86 
 
 		 94 aa  50.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.297512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4756  hypothetical protein  37.04 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>